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Epos3、Focus 5.3. 20
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TADPRO 3.2.1
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SUN WorkShop. 29
BXPro 6.13 (Builder Xcessory) 29
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Geomap 3.2地质绘图软件包
Power Challenge并行机系统
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GULP (General Utility Lattice Program)
计算材料科学Mathub
绿色化学专家系统The Green Chemistry Expert System (GCES)
统计学数据集、软件StatLib (archive of statistical datasets and software at Carnegie Mellon University)
FEATFLOW 软件(有限元方法计算和计算流体力学)
MARVIN'S PROGRAM (表面与界面模拟)
3E Company (在线MSDS管理和信息服务商)
Actio Corporation (在线化学品管理解决方案)
ANSYS CFD FLOTRAN使用指南
ANSYS Inc. Corporate (工程模拟软件)
ANSYS使用手册
AspenTech
Autoplant plant design software
BARON (非凸性函数全局最优化问题求解)
CCSE Applications Suite
CFD(计算流体力学)的软件, 数据, 视频和文字资料 (美国爱荷华大学IIHR-水利科学与工程研究中心发布)(部分)
CFDTutor and CFDExpert (CFD学习与模拟软件)
ChemiSoft (化学工程相关软件目录)
ChemSage (无机物相图计算)
ChemSep (多组分分离过程计算软件)
Chemstations (过程模拟)
COADE, Inc. (管道应力分析与设计、压力容器设计)
DESIGN II for Windows (过程模拟软件)
DIPPR (物性数据)
DR Software, Inc. (MSDS管理软件)
Element DataSystem (环保实验室信息管理系统)
Environmental Technology Network (与环境有关的过程软件)
EPI Suite(与环境有关的物性估算程序包)
ePlantData (过程数据交换方法)
ESM Software(材料科学与工程软件)
Flavor Selector 5.0 (调味剂管理工具)
Fluent Inc.(CFD软件、流动和传热模拟)
General Algebraic Modeling System (GAMS, 数学规划软件
Haddock HazCom (MSDS专业服务公司)
HSE Systems (MSDS软件开发以及管理服务商)
Hyprotech (过程模拟)
IDES
ImageTrak Software (MSDS管理软件开发与服务)
ImageWave Corporation (MSDS管理数据库和服务商)
InfoDyne Softwares (MSDS的建立与管理软件, 针对欧洲标准)
LabView(仪器编程的图形化编程环境软件)
Logical Technology, Inc. (环境卫生和安全EH&S软件和服务)
M-Base Company (物性数据库和设计软件)
MINOPT (模拟优化线性、非线性、混合整数、动态、混合整数非线性问题求解)
Modeling Fluid Flow using Smoothed Particle Hydrodynamics
Moldflow Corporation (注塑模拟)
MSDS Archive (将纸载体的MSDS文件转换成符合OSHA标准的电子文档)
MSDSpro (MSDS和化学品管理服务)
MSDSystem (MSDS 管理, 搜索和修复软件)
OLI Systems (水溶液系统的模拟计算)
Pacific Simulation (造纸过程模拟)
ParCFD Test Case
PenSim v2.0(青霉素发酵批处理过程模拟软件，)
Philadelphia Mixers (搅拌器/混合器)
PHOENICS (流体力学计算软件)
Prosim (过程模拟软件)
德国SIGMASOFT仿真软件
MoldFlow MPI 注塑成型模拟分析
FLUX电、磁、热场分析软件
Reaction Design (反应、物理汽相沉积PVD)
SafeTrax (MSDS创建工具)
I-Logix Rhapsody 嵌入式仿真开发软件
Scandpower AS (石油业咨询、过程模拟)
Selerant (配方产品管理工具, 技术数据表Technical Data Sheets, TDS创建工具)
SGI应用于化学、生物信息学的软件、硬件产品
Sim42 (公开源代码的化学过程模拟器项目)
Simons Technologies, Inc.
Simulation Sciences Inc. (SIMSCI)
Spotfire(决策支持软件Spotfire DecisionSite)
Sunrise Systems (管道流动模拟)
Talos (MSDS 管理软件)
THERIAK-DOMINO (平衡态及相图计算)
Virtual Materials Group, Inc. (面向过程工程的热力学应用产品开发)
WinSim Inc. (Windows、过程模拟软件)
并行分子动力学模拟软件DoD-TBMD
过程控制流程图绘制与管理软件ControlDraw 1
过程模拟环境ASCEND
韩国岭南大学计算应用流体实验室开发的CFD模拟软件
化学反应动力学模拟JavaScript Kinetics Simulator
化学工程软件目录, www.cheresources.com
化学平衡计算程序EQS4WIN
汽车动力学仿真软件CarSim
挥发性有机物对大气对流层影响的模拟(Tropospheric Chemistry Modelling)
ANSA V12.0.3(全球通用的强大的计算机辅助设计软件,用于将几何曲面的描述转换成适合进行CAE分析的模型)
计算流体力学软件CFX
空气和废气性质计算(Air and Exhaust Gas Properties V1.2)
流化床模拟分析软件ERGUN 6.0
流体动力学模拟软件包：FOAM
生物动态成象系统
水溶液反应库及平衡计算Joint Expert Speciation Syetem (JESS)
填料塔计算Packed Column Calculator
烃类二元、三元系平衡模拟软件Equilibria
物性数据库和工程小软件PhysProps, EngVert, PipeDrop
下载与交换MATLAB开发的程序
相图计算软件MTDATA
过程设备强度计算软件包SW6-1998
3M公司(明尼苏达矿业及制造公司, Minnesota Mining and Manufacturing Company)
Accelrys 材料科学软件
Actio Corporation (在线化学品管理解决方案)
Actio 公司 (提供MSDS服务)
ADS-Limathon (化学实验室数据库及管理软件)
Advanced Chemistry Development (ACD)
AEA Technology
Aeon Technology Inc
ANSYS Inc. Corporate (工程模拟软件)
Applera Corporation (生命科学技术和信息管理软件)
Eagleware Genesys v2004(世界领先的射频微波设计软件)
Applied Biosystems (仪器，试剂，软件和技术服务)
Argonaut Technologies (药物相关的软件、仪器)
Barnard Chemical Information (BCI) Ltd (化学结构多样性分析软件)
BIO-RAD: Sadtler的软件/数据库产品
Bioreason (化学结构分类软件)
BioWisdom (医药术语、同义词库，平台工具)
C&L Instruments, Inc. (荧光仪器/软件)
CAChe, Fujitsu Limited
CambridgeSoft Corporation
CAMO (实验设计、多变量数据分析)
CG Information (BiblioWeb文献管理工具)
ChemCodes (药物开发平台软件)
Chemical Computing Group Inc. (化学计算)
Chemical Concepts (提供光谱数据库和软件的公司)
Chemizen.com., Inc.(亚洲地区化学工业信息数据库)
ChemNavigator
Chempute Software (化工软件)
COADE, Inc. (管道应力分析与设计、压力容器设计)
CompuDrug International, Inc. (药物设计与发现、预测软件)
ControlDraw Ltd.
Current Drugs
Cyprotex (药物代谢动力学)
Dash Optimization Ltd.( 模拟与优化软件产品)
Daylight Chemical Information Systems, Inc (结构信息处理、化学信息系统开发环境)
Deconvolution and Entropy Consulting (谱图分析)
DIMENSION 5 (数据挖掘软件)
Dolphin Software (MSDS及相关软件)
DR Software, Inc. (MSDS管理软件)
DTW Associates, Inc.(高分子物性及相关软件)
Entropia, Inc. (PC网格计算)
Environmental Support Solutions, Inc.(ESS, 环境卫生与安全和应急计划软件服务商)
ePlantData (过程数据交换方法)
ESI Group (虚拟设计测试软件)
Formation Systems Inc. (Software for Product Development)
Galactic (谱图数据处理软件)
Gaussian, Inc.
genamics (信息检索和基因分析工具)
Get The Patent (整篇下载各国专利的扫描图像全文)
Gold Standard Multimedia (医疗教育和药物信息开发公司)
Golden Helix, Inc.(数据挖掘和化合物筛选软件)
Grabitech Solutions AB (实验设计与优化软件)
Graffinity Pharmaceuticals (化学基因组学)
Gulf Publishing Company (油气工业出版商)
Haddock HazCom (MSDS专业服务公司)
HighChem, Ltd. (质谱软件)
Hypercube, Inc. (分子模型化软件)
IDBS (药物发现软件)
IDES
ImageTrak Software (MSDS管理软件开发与服务)
ImageWave Corporation (MSDS管理数据库和服务商)
InfoDyne Softwares (MSDS的建立与管理软件, 针对欧洲标准)
Infometrix, Inc. (模式识别)
Inpharmatica (药物发现平台)
Lab Control
LabBook (生物信息和知识管理平台)
Leadscope (化学信息学)
Leffingwell & Associates (为香味剂、香料、食品和饮料企业提供服务和软件)
Libraria (药物发现专家系统)
LION bioscience (药物发现平台)
Logical Technology, Inc. (环境卫生和安全EH&S软件和服务)
M-Base Company (物性数据库和设计软件)
Madison Technical Software Inc.(热传递和物性计算软件)
MathSoft Engineering & Education, Inc.
Maximum Entropy Data Consultants (Bayesian数据分析用于信号增强)
MDL Information Systems, Inc.
MDS Sciex (质谱仪器)
Micromass (质谱仪器)
Fluent FloWizard 2.1.8一流的流体模拟工具
Misys Healthcare Systems (医疗信息系统)
Moldflow Corporation (注塑模拟)
Molecular Discovery Ltd. (医药研究领域的科学软件)(部分)
Molecular Knowledge Systems, Inc. (物性估算)
Molecular Networks GmbH (计算机化学)
Molecular Simulation Inc. (MSI)
Molinspiration Cheminformatics (独立的化学信息学研究机构)
Molsoft L.L.C.(分子模拟和药物设计软件和信息)
MSDSpro (MSDS和化学品管理服务)
MSDSsolutions (MSDS数据库和软件工具)
MSDSWorld (MSDS 发行管理服务)
National Instruments Corporation
NuGenesis Technologies Corporation (药物发现数据管理平台)
O-Matrix (卡尔曼滤波Kalman filters)
OpenEye (快速计算分子的静电性质、形状)(部分)
Oxford Molecular
PerfumersWorld Ltd.(为芳香剂和香料专业人员提供服务)
Pharma Algorithms(药物发现的软件和平台)
Prous Science (医药出版商)
Quest Consultants Inc.
Scandpower AS (石油业咨询、过程模拟)
Schrodinger(药物相关的软件)
Scientific Instrument Services, Inc. (质谱仪和气相色谱服务商)
SciQuest, Inc.
SciTegic(药物相关的软件)
SciVision
http://www.brrsoft.com.cn
www.brrsoft.com.cn
Selerant (配方产品管理工具, 技术数据表Technical Data Sheets, TDS创建工具)
Silicon Valley X-ray Site (X射线仪器、软件等)
SimBioSys (药物设计软件SPROUT)
Simulations Plus, Inc.(药物相关的软件、教学模拟软件)
SMI Corporation
SOLUTIONS Software Corporation (美国联邦法规、MSDS数据库等)
Spotfire(决策支持软件Spotfire DecisionSite)
Statistical Designs
Sunrise Systems (管道流动模拟)
Synopsys Scientific Systems Ltd.
Synthematix, Inc. (化学合成管理工具)
The MathWorks (MATLAB, technical computing software)
Thermo Electron Corporation
Thermo-Calc Software (热力学计算、合金体系扩散控制计算)
Trega Biosciences, Inc.
Tripos, Inc. (计算机辅助药物设计)
Umetrics (实验设计、多变量数据分析)
Virtual Materials Group, Inc. (面向过程工程的热力学应用产品开发)
Waters Corporation (高效液相色谱、质谱)
WavBox (小波变换)
WinSim Inc. (Windows、过程模拟软件)
上海申迪软件工程有限公司（SATech）
Stat-Ease, Inc.(实验设计软件)
材料模拟计算算法库MAP
化学工程进展CEP的化工软件
计算材料科学Mathub FEATFLOW (计算流体力学)
MARVIN'S PROGRAM (表面与界面模拟)
Chemical Online最新发布的化工软件
ANSYS Inc. Corporate (工程模拟软件)
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ChemSep (多组分分离过程计算软件)
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Moldflow Corporation (注塑模拟)
OLI Systems (水溶液系统的模拟计算)
Pacific Simulation (造纸过程模拟)
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Reaction Design (反应、物理汽相沉积PVD)
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过程相关的单位换算在线工具统计学数据集、软件StatLib
HyperCard(苹果公司文档管理工具软件) Origin
CAMO (实验设计、多变量数据分析) CurveExpert (数据拟合)
Deconvolution and Entropy Consulting EXPGUI (结构分析系统图形用户界面 )
Numerical Recipes (数值分析方法库) Statistical Designs
Umetrics (实验设计、多变量数据分析) 单位换算在线工具(WWW unit converter)
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化学标记语言CML化学反应动力学模拟
数据处理、图形显示及编程工具IGOR
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Discovery Studio药物发现的崭新平台
InsightII最权威的生物分子模拟软件
Catalyst基于药效团的药物设计软件
Cerius2著名的药物设计软件
Accelrys GCG生物信息学分析软件
CrossFire Beilstein有机化学数据库
MDL Patent Chemistry DB专利化学数据库
Pipeline Pilot流水线式数据挖掘工具
ISIS/Host化学信息管理系统
Thermo LIMS 实验室信息管理系统
Assay Explorer 生物信息管理系统
Thomson Pharma医药信息平台
Horizon Global 原料药竞争情报数据库
分子模拟、化学信息学、生物信息学软件Accelrys
化学信息学软件MDL
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化学信息学软件Thomson
实验室信息管理系统Thermo
过程模拟及工艺计算软件
AspenPlus10.2/11.1/12.1/13.1
PRO/II5.01/5.61/6.0/6.01/7.0/7.01/8.0
HYSYS2.2/2.4/3.01/3.1/3.2
KBC Hysys Refinery1.1
DESIGN II8.40/8.50/9.05/9.11/9.31
ChemCAD5.0/5.1/5.2/5.3
SuperPro  Designer4.53/5.1b3
VMGSim2.1/2.2/2.3/2.4/2.5
WinGEMS5.3
DynSim4.0/4.1/4.1.1/4.1.2
OTS Engine4.0
FSim Plus3.2
PVTSim13.0
gPROMS2.3.4
DataCon3.1/3.13
DISTIL5.0
EPCON.SYSTEM.Process.Explorer7.0
热力网络及换热器设计模拟软件
HX-Net5.0,HEXTRAN8.0/8.1/8.11
HTFS2001
HTRI4.0sp3
HeaTtPro4.4.6
Chemkin3.6/3.7/4.0
管路设计分析优化软件
CAESAR II4.2/4.4
Autopipe2004
AFT Arrow/Fathom/Impulse/Mercury/Titan2003/2004/2005
INPLANT3.02/3.03
VisualFlow4.0/4.1/5.0
PIPEPHASE8.0/9.0/9.1
FluidFlow2.32/2.33/2.34
Pipedrop1.2.3
Flarenet3.51a
PIPESIM2003 v1.0
Epcon.Chempro.Engineering.Suite6.3/6.31
工厂设计及配管绘图软件
Autoplant3D 2.0/2.1/3.0/2004
Autoplant P&ID16.0/2004
VANTAGE PDMS11.5/11.6
Intergraph SmartPlant 3D v03.00.15.00
P&ID 2.2
Intools 5.2、5.3
Bentley PlantSpace8.0/8.1/8.5
ProCAD 3DSMART 2003/2005
ProCAD 2D Designer 2002/2004
Cadpipe2002 for AutoCAD
Coade Cadworx 2005/2006
Alias Piping Solutions系列工厂设计软件
设备容器设计分析软件
SW6-1998 V3.0/3.1
LANSYS 1.2
PVelite5.0/2004/2005
CODEWARE COMPRESS BUILD_6245
Paulins2005
Comcad V2
Silence2.1
CMCAD 2001
塔类水力学核算软件
Sulpak3.0
KG-Tower2005
Norton Column Rating1.03
FRI-Tray Rating 1.07
FRI-Device Rating 1.1.4
Materials Studio
InsightII
Cerius2
Catalyst
Quanta
GCG
Felix
TOPKAT
TSAR
Accord
Discovery Studio
Pipeline Pilot
CNX
数据库
生物活性数据库
筛选用数据库
CrossFire Beilstein
CrossFire Gmelin
ISIS
Elan
CIMS
Direct
Select
合成方法和转化数据库
化学物质源和安全数据库
化合物代谢、毒性、药理学数据库
化学专利数据库
Discovery Gate
Thomson Pharma
Horizon Global
IDdb
BioEdit
MEGA
Swiss-PdbViewer
Clustal X
PHYLIP
PyMol
ClustalW
pDRAW32
RasMol
TreeView
分子建模及显示分析工具：
Discovery Studio系列产品
化学数据库管理工具：
ISIS/Base
Accord for Access
Accord ChemExplorer
Accord for Excel
生物信息学分析软件：
Discovery Studio Gene
Darwin LIMS
Watson LIMS
FASTRIP_PRO_V8.0
Caspoc
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Codewarrior
CYME International
EDSA电力系统分析软件
CAD2CAD TrueDTP 1.28 (CAD转换工具)
CAD2CAD DWG Express 7.01 (CAD转换工具)
SynaptiCAD Allproducts V10.20b (电子设计自动化)
Procad 3DSmart 2005 2 (工业设计)
Autodesk AutoCAD 2007 零售版发行
PERICAD 2006 for AUTODESK Architectural Desktop 2006 (CAD插件)
Acme CAD Converter 6.51 (CAD图形管理)
CG Academy Intermediate Texturing 1: The Unwrap UVW Tool (Max8纹理贴图教程)
TurboCAD Professional 12 (2D/3D设计软件)
Cadence Specman Elite 5.0 Linux版 (EDA逻辑验证工具)
CAD2CAD TrueDTP 1.28 (CAD转换工具)
CAD2CAD DWG Express 7.01 (CAD转换工具)
HyproTech.HTFS.Software.(7模块完全版)
    软件包括：
     ---->ACOL 6.20 错流换热器的设计、模拟软件
     ---->APLE 2.10 板式换热器设计及校核软件
     ---->FIHR 2.00 直接火加热换热器的模拟设计
     ---->FRAN 2.01
     ---->MUSE 3.20 板翅式换热器设计与模拟软件
     ---->PIPE 5.20
     ---->TASC 5.00 管壳式换热器传热设计、校核、模拟和机械设计软件
Frontline Systems Solver Platform SDK
Xtreme suite Pro 2006 for Active-X Com
Sonnet.Suite.pro(三维高频电子设计)
德国LANG公司CNC雕刻机软件
lergocad
relief designer
UpToDate v13.1 (医学资料库)
ANSYS Mechanical10.0
ANSYS/CIVILFEM 10.0
终端软件Arena
GH Bladed世界领先的风机设计计算软件
DADS动态分析软件 + 使用手册
VHDL软件
ANSOFT MAXWELL.EM V10
MSC Marc Autoforge (各种冷热锻造、挤压、轧制以及多步锻造等体成型过程模拟)
AscTrend 3.5 for Tradestation
NI LABVIEW 8.2软件:
LABVIEW核心开发者套件，包括：
       SignalExpress
LabVIEW专业版开发系统
LabWindows/CVI完整版开发系统
企业连接工具包
VI分析器工具包
State Diagram工具包
Express VI开发工具包
报告生成工具包
高级信号处理工具包
PID工具包
数字滤波器设计工具包
Measurement Studio企业版
LabVIEW DSC（数据记录与监控）模块：
工业自动化服务器
实时程序部署功能选项：
包括组件
LabVIEW 实时(RT)模块  R
LabVIEW Execution Trace Toolkit
PDA程序部署功能选项：
包括组件
用于掌上电脑的LabVIEW PDA模块
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LabVIEW 8.20 Real-Time Module(RTX) with 1 Year Standard Service
Geomap地质绘图软件包 3.1
MAPGIS 6.5
MicroStation 8.1
AVS/EXPRESS 5.0
NDS测井曲线矢量化 4.1
SDI CGM绘图，图形工具，包括图形转换及拼图
LOGPLOT 2003
Arcinfo Deskiop 8.2
Mapinfo MapX 5.0
SF2、MAGMA地震图矢量化和格式转换 2.0
R２V 5.0
CPS-3 5.0
Zeh PlotExpress4.3.0.2
Suffer 8.0
Larson CGM Studio 8.3.5
Larson CGM Import Filter 8.4.2
兰德马克(LandMark) Release 2003软件包
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Discovery 2003微机版
SMT 7.4
WellCAD 3.1
Forward 2.5
DSS 储层动态管理(Dynamic Surveillance System) 2003
GOCAD 2.0.7Windows平台微机版、X Window平台工作站版
CARBON 2003
地震资料处理软件包：
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VistaWindow 2D/3D 3.0
克浪 KLANG 3.0
FracproPT 10.1 中文版
其他工程类软件
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ASPEN11.1
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SOLID-C
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System Architect 10.4
系统仿真软件showflow/processmodel/enterprisedynamics showflow
plc仿真软件gx-Simulator 6
SolidWorks、MoldOffice、3DQuickPress、Moldex
3Dquickpress (solidworks冲模设计插件)
化工设备中心站的PVCAD3.1
SIMATIC Protool V6.0 + SP2 西门子(SIEMENS) 触摸屏编程软件
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北京斐克VNUC v3.0版仿真软件
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通用CAD/CAM软件ProCAM
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Altair HyperStudy7.0
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包裹体压力模拟软件VTFLINC
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LinkCAD转换工具软件(不同格式图纸转换)
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Ctech EVS And MVS v6.6(地理学分析软件。供地质学者、海洋学者、考古学家分析地质地据)
Ansys V10.0中文版
综合油气生产管理与优化设计软件PEOffice
FLUENT6.2---基于非结构化网格的通用CFD求解器
GAMBIT 专用的CFD前置处理器（几何/网格生成）
FIDAP 基于有限元方法的通用CFD求解器
POLYFLOW 针对粘弹性流动的专用CFD求解器
MixSim 针对搅拌混合的专用CFD软件
Airpak 强大的通风系统分析软件
FloWizard 针对设计工程师使用的通用CFD求解器
GPPW工控软件
myriad 7.0
Crystal reports XI vcl for delphi
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FlowMaster2 v6.4.1(流体液压系统仿真工具,用于管道流体系统仿真)
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TDM工程数据管理平台软件
虚拟实验室LMS Virtual Lab
噪声分析软件LMS Sysnoise
OPTIMUS 过程集成与优化设计平台软件
AUTOFORGE V3.1 SP1
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Rockwell Software产品:
Rockwell Arena 7.01-ISO 1CD（生产系统规划仿真软件）
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silos-x仿真软件
CodonCode Aligner DNA分析序列拼接软件
DNA分析
JaMBW 1.1 分子生物学软件包。
ANNHYB 4.938 用来帮助进行PCR引物设计与基因探针设计的软件。
Chromas 2.32 ABI格式文件显示与编辑软件。
DNAProbe 核苷酸序列设计工具。
DnaSP 4.10.9 基因多态性分析软件。
DFW 2.51 trail DNA分析软件。
Artemis R9 以Java语言写成的序列查看工具。
ACT R6 以Java语言写成的序列比较查看器。
GDA 1.1 主要用来进行不连续基因数据的统计分析。
Sequencher 4.8 序列拼接软件。
MeltCalc 2.06 自动计算DNA序列热力学数据的Excel电子表格宏软件。
ConsInspector 3.3 DNA蛋白结合位点预测识别软件。
GenomePixelizer 2003.10.1版帮助理解基因组中的簇基因（clustering gene）之间的相互关系的软件。
Gene Construction Kit 2.5 Demo 管理并显示克隆策略中的分子构建过程软件。
GenescanView 1.2 查看基因扫描（genescan）格式.fsa文件的小软件。
Sequin 7.77 数据库GenBank, EMBL, DDBJ 查询软件。
DNAuser 1.0 DNA序列处理软件。
最大最专业的软件提供商>咨询QQ：773522
GenomeComp 1.3 中科院生物物理所生物信息实验室推出的可视化的微生物基因组比较工具
Apollo 1.6.5 Java语言开发的基因组注释显示编辑软件
SNPHunter 1.75 SNP（单核苷酸多态性）查找软件。
SSRHunter 1.3 SSR（Simple Sequence Repeat，即简单序列重复，又称微卫星DNA）位点查找软件。
iCE 3.5 Java语言编写的显示基因指纹图及相关数据的软件
MB6.84 免费的DNA分析软件
FinchTV 1.4 免费的DNA图谱分析软件；
Sequence Scanner v1.0 显示分析ABI基因分析仪DNA图谱数据软件，
CodonCode Aligner 2.0.1 DNA测序trace图编辑、突变分析、contig编辑、序列拼接软件。
WinGene 2.31 分析核酸序列的多用工具软件；
BioLign 4.0.6 还增加免费序列拼接软件；
PIC_Calc 0.6 多态信息含量计算程序。
SequenceViewer 1.0 DNA序列图形显示软件；
SERIAL CLONER 1.2 DNA序列分析工具软件
Xplorer 2.4.2 DNA图谱查看分析软件
生物化工　
brd.zip 生物反应器（发酵罐）设计软件。
BioStat 4.3 BioStat B发酵罐控制程序。
PenSim v2.0 青霉素发酵模拟软件。
BioProSim 4.0 发酵实时模拟软件。
SuperPro Designer 6.0评估版计算机辅助设计特别是生物工艺设计的软件包。
FRAE 2.01 发酵记录分析专家。
进化分析　
phylip 3.65 进化树分析软件，并可绘制进化树。
TreeView 1.6.6 进化树处理软件。
GeneTree 1.3 比较基因与种系进化树的程序。
NDE 0.5.0 用来编辑NEXUS格式文件的程序。
TreeMap 1.0 用来可视地比较主、从进化树的程序。
Spectrum 分析进化信息而不用将之转化为进化树的软件。
Phyltools 1.32 计算与处理进化树数据的软件。
tree-puzzle 5.2 核酸序列、蛋白序列相似性分析及进化树构建工具。
ATV 1.92 JAVA语言编写的显示"New Hampshire"与NHX格式的进化树文件软件。
TREECON 1.3b Demo 构建和绘制进化树的软件包。
ProBiosys 0.9 比较表现型分类法数据和分析计算核酸序列数据距离值的软件。
COMPONENT 2.0 分析进化树免费软件。
NJplot 小巧的显示进化树的免费软件NJplot。
MEGA 4.0 免费分子进化遗传分析软件
PAUP 4 PAUP的快速使用手册
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TreeSAAP 3.2 蛋白序列进化分析软件；
mesquite 2.0 进化分析软件
PAL 1.51 进化分析java程序库；
Vanilla 1.2 使用PAL编写的进化分析命令行程序；
SplitsTree 4.8 JAVA程序编写的分析和显示进化数据软件；
TCS 1.21 JAVA程序所写的进化网络分析软件；
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REAP DOS下的进化分析软件包；
T-REX 4.01 进化树构建分析软件；
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SymmeTREE 命令行差异分析软件
Phylogenetic Visualization tool 进化树显示工具
TREEFINDER 200706版计算进化分析软件
PHASE 2.0 序列进化分析软件；
BAMBE 2.01b 分子生物进化分析软件；
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