 bioinformatics(5)
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发信人: happymood (土豆块儿), 信区: Bioinformatics
标 题: bioinformatics(5)
发信站: 北大未名站 (2001年04月10日16:27:55 星期二), 站内信件
发信人: RolandGarros (永远的阿加西), 信区: LifeScience
标 题: 用生物信息学分析细胞与组织结构--TissueInformatics
发信站: BBS 水木清华站 (Sat Feb 24 08:02:38 2001) 用生物信息学分析细胞与组织结构--TissueInformatics公司简介
生物引擎 伍活镰 编译 2001-2-22
组织信息学(Tissue informatics)即生物信息学在组织学的应用，这一学科的出现
填补了在获取人体每一个成分细节、建立巨大的信息数据库过程中出现的一个重要的空
白。21世纪生物学的建立基于庞大的人类基因组计划数据库，而新世纪的解剖学将依赖
于国立医学图书馆建设中的可见人体数据库--冰冻尸体毫米薄片数字照相数据库。在分
子生物学与解剖学之间存在一个新的领域--研究细胞与组织结构的生物信息学。
1997年，匹兹堡大学一位内科医师Peter C. Johnson认识到生物信息学可应用于组
织样品显微分析。数字成像技术可以能够使细胞和组织结构分析完全定量化和自动化，
而一旦将细胞和组织结构图象分析和基因表达数据相结合，科学家就可以更深入了解基
因是如何导致疾病的。在这一前景的激励下，Johnson于匹兹堡成立了组织信息学公司（
TissueInformatics, Inc.），这个全新的公司以生物信息学为商标，主要从事组织工程
和新药开发。
图片说明：从组织获得的信息因染料，光波长，蛋白和基因表达技术的不同而各有差异
，再通过自动分析软件对所有检测到的细胞成分进行定量分析。
作为一个组织工程公司，TissueInformatics 拥有自己的质量管理软件，对皮肤组
织产品进行自动化质量控制。Johnson说："皮肤组织产品完成后必须在几个小时之内运
送到需要的医院，以最大限度延长其有效存活时间，因此对其质量控制需要准确，迅速
。而且，必须能够在产品质量发生变化的早期就作出反应。"
利用显微机器人，这个软件能自动获取显微镜载片上的工程皮肤的图象，并分析它
的健康状况，包括单个细胞和整个皮肤的状况。这一软件还能通过分析细胞数量和分布
，细胞密度，排列，形状和厚度等指标，判断皮肤结构是否正常。公司的科学家可以根
据软件数据来减少皮肤产品的误差，研究这些图片来改进皮肤工程技术。 TissueInfor
matics 提出的口号是多样化，其图象分析软件不但能够分辨组织染色和细胞结构（例如
核酸），而且可应用于荧光或原位杂交表达技术中。这一软件对肉眼可见组织可进行分
析和定量，而对肉眼不可见物质，其光谱成像技术也能达到红外线或紫外波长分辨范围
。
图片说明：TissueInformatics 通过对细胞和细胞内成分的位置进行定量来分析组织结
构，这些数据可提供组织内任何可见部分的详细信息。上图是一个皮肤样品分析。
TissueInformatics 还向制药公司的病理学研究者提供组织分析服务，Johnson称这
些人为"病理学专业户（corporate pathologists）"，因为他们日复一日通过显微镜查
看同样的细胞样品，寻找对试验药物产生良好或者毒性反应的组织特征。这些图象被医
药公司保存起来并加上分析结果注释，建立虚拟组织文库以备后用。到2002年，这些公
司就可以通过网络将自己的组织文库与TissueInformatics公司的组织图象数据库进行比
较。
Johnson经营公司以软件为主打产品，比如软件Dermf(x)，可以对皮肤的特性进行定
性和定量分析，除了可用于皮肤工程学外，在皮肤药物运输、创伤治愈、美容等领域都
得到广泛应用。
Johnson同时也看好通过组织信息学技术将基因和蛋白质表达分析相结合成数据库，
他认为这对于从事分子和细胞活性研究的科学家是一个非常好的发展方向，这类数据库
将大大丰富对疾病和药物作用的认识。这也是他目前公司的发展方向。
Peter C. Johnson, TissueInformatics 总裁，公司地址：711 Bingham St., Suite 2
02, Pittsburgh, PA 15203.电话: 412-488-1100. 传真：412-488-6172.
作者介绍：Tom Hollon，科学作家和编辑，现居住于Maryland州Rockville。为杂志Mod
ern Drug Discovery主要编辑，之前曾在国立健康研究所，巴斯德研究所和华盛顿大学
从事研究。联系：thollon@starpower.net.
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